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单链建库技术助力RNA-seq在科研及精准医疗领域应用

近年来,高通量测序技术已经彻底改变了生物学和医学等学科的研究方式,使得在单碱基水平上对大量样本的核苷酸序列进行检测成为可能。

2021-12-27

单细胞RNA-SEQ揭示胰腺未分化癌破骨细胞样巨细胞瘤微环境的异质性

在胰腺肿瘤中,未分化癌是一种罕见且高度侵袭性的亚型,其组织学特征往往是高间质、多形性大细胞癌、梭形细胞癌,有时还包括肉瘤样癌。

2022-07-08

Molecular Cancer: 单细胞RNA-seq分析发现一种非编码RNA介导肝癌对索拉非尼治疗的耐药性

索拉非尼是一种多激酶抑制剂,是fda批准的一线药物,用于治疗不能切除的肝细胞癌(Hcc)。不幸的是,这些患者的治疗效果微乎其微,总体生存期仅提高了3个月。在初步应答后,大多数肝癌患者出现抗药性和疾病进展。

2022-01-22

Science:利用Record-seq技术记录肠道细菌的基因表达

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院、巴塞尔大学、伯尔尼大学和博特纳儿童健康研究中心的研究人员为肠道细菌配备了数据记录器功能,以此来监测肠道细菌中哪些基因是活跃的。

2022-05-16

非编码RNA: 长非编码RNA DDX11-AS1与HNRNPC结合促进胶质瘤细胞增殖和迁移

该研究表明,DDX11-AS1/HNRNPC轴可能在脑胶质瘤的发生发展中起重要作用,为脑胶质瘤的诊断、治疗和预后提供了新的思路和治疗靶点。

2022-06-20

RNA:基因组研究揭示基本RNA基因意想不到的变异特性

来自约翰霍普金斯大学等机构的科学家们通过进行一项基因组研究,找到了一种被认为是合成蛋白质的微管结构的基本组件的基因突变。

2022-02-08

Genome Biol:开发出NT-seq方法,可同时检测细胞中的三种不同类型的DNA甲基化

细胞控制它们的基因活性的一种方式是在DNA上添加小的化学修饰,以决定哪些基因开启或关闭。

2022-07-14

揭示IscB-ωRNARNA引导下切割DNA机制

CRISPR-Cas9系统利用向导RNA(gRNA)识别靶DNA序列。当发现匹配的DNA序列时,Cas9蛋白会在正确的位置切割靶DNA,然后就有可能在DNA水平上进行外科手术来修复遗传疾病。

2022-05-30

Cell:更为紧凑的靶向RNA的基因编辑工具Cas7-11S问世,有望基于此开发出新型RNA基因疗法

在一项新的研究中,他们与东京大学的合作者合作,发现Cas7-11可以缩小到一个更紧凑的版本,使其成为编辑活细胞内RNA的一种更可行的选择。

2022-06-08

Nature Communications:理性设计RNA瞬态结构上取得进展

RNA在溶液中除了存在自由能较低的高丰度的基态构象(Ground States),往往还存在自由能较高的低丰度的激发态构象(Excited States,也称瞬态构象)。多种构象之间的切换在RNA与配

2022-04-04